異能を保有する者達が【サイキックホルダーズ】略して【ホルダー】と呼ばれる現代。地方の警察官をしている稲月雷輝という青年は、雨が降りしける中、路地裏で着物をきた黒髪の少女と出会う。彼女は記憶喪失で、裏の世界から追手が来ていた。稲月雷輝は彼女を守る正義心から、裏の世界へ通じる黒い渦に飲み込まれたのだった……